视网膜分支动脉阻塞的主要源头在于血栓的形成或栓塞。这些血栓的来源多种多样，涵盖了多个层面的生理病理因素。颈动脉胆固醇血栓是一大来源，其形成往往与血管壁的沉积物累积有关。随着胆固醇和其他脂质的沉积，颈动脉内壁会逐渐硬化，进而形成斑块，最终可能破裂形成血栓。这种血栓一旦脱落，就有可能随血液循环到达视网膜分支动脉，引发阻塞。
除此之外，大血管动脉硬化血小板纤维蛋白血栓也是重要的原因。当大血管发生动脉硬化时，血管的弹性和通畅性都会受到影响，导致血流速度减缓，为血栓的形成提供了条件。这些血栓可能是由血小板和纤维蛋白集结而成，一旦形成并脱落，同样会对视网膜分支动脉造成阻塞。
更为罕见的是由心瓣膜钙化引起的心粘液瘤栓。心瓣膜钙化会导致心脏功能下降，心粘液瘤的形成也可能因此受到影响。这些心粘液瘤栓有可能随着血液循环进入视网膜分支动脉，造成阻塞。长骨骨折时可能产生的脂肪栓以及感染性心内膜炎的菌栓等，也可能成为视网膜分支动脉阻塞的源头。
至于视网膜中央动脉阻塞的系统原因（CRAO），则涉及更为复杂的生理机制和系统因素。总体来说，视网膜动脉阻塞是一种严重的眼部疾病，其成因复杂多样，治疗难度大。对于出现相关症状的患者，应尽早寻求专业医疗帮助，以便得到及时有效的治疗。
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